В центре сюжета мультфильма «Ночь в зоопарке» – милый белый кролик, который оказывается в эпицентре фантастических событий. Происходит нечто странное: в зоопарке падает меленький кусочек метеорита из далекого космоса, любопытный кролик проглатывает его и превращается в неизвестное чудище. Монстр хочет захватить зоопарк, а всех его обитателей сделать жуткими гибридами. Чудище начинает создавать неизвестные гибриды из горилл и рыбы, зебры и оленя, слона и змеи. Никто из обитателей зоопарка не может остановить это безумие. И только храбрый лев, которого чудище хочет побудить с диким кабаном, решает дать отпор…