Безжалостный наемник Ханзо Хасаши, будучи членом клана Ширай Рю, был убит во время атаки группировки, возглавляемой Саб-Зиро. В обмен на вечную преданность могущественному колдуну Куан Чи, Хасаши получает шанс вернуться в мир живым, став Скорпионом — потерянной душой, жаждущей мести. В то время, как Скорпион приближается к власти в престижном турнире «Мортал Комбат» на острове Шан Ца, Джон Райдэн собирает команду элитных бойцов — шаолиньского монаха Лю Кана, офицера спецназа Соню Блейда и актера Джонни Кейджа, стремящихся спасти мир от уничтожения. Чтобы решить сложнейшее задание, главному герою предстоит слестнуться в противостоянии с лучшими воинами, избежать устроенных Шан Цунгом ловушек и научиться действовать, как единая команда...